ОУО осуществляет сбор, временное хранение, обезвреживание и упаковку отходов для передачи на лицензированные предприятия по переработке. В соответствии с Сан ПиН 2.1.7.728-99 «Правила сбора, хранения и удаления отходов ЛПУ» все отходы ГБУЗ СОКОД имеют четыре класса опасности: А, Б, Г, Д и хранятся только в местах предусмотренных Проектом нормативов образования отходов и Лимитов на их размещение (ПНООЛР). Осуществляется разработка мероприятий, направленных на выполнение требований экологического законодательства по соблюдению стандартов и нормативов. Ведется разработка и согласование инструкций по правилам обращения с опасными отходами.